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年度报告

2013年年度报告

新闻类型:年度报告    发布时间:2014/2/20 0:00:00    作者:SKLBC     浏览次数:298

 

有害生物控制与资源利用国家重点实验室2012年年度报告

 

一、年度工作计划总结

(一)自主研究课题

2012年实验室实施PI制度,围绕实验室研究目标和方向,以PI团队形式分别设置了32项特色课题,资助总额500万元。主要研究进展为:

1、生物多样性及其控害功能

1)推算出当前物种灭绝的准确速率

估计物种灭绝速率的传统方法是建立在所谓“种—面积曲线”的理论之上,基于此方法所得到的物种灭绝速率总是大大高于实际的物种灭绝速率。本课题组以严谨的数学证明和大量实验数据推翻了上述结论。“种—面积曲线”采用倒推法,忽略了一个严重的问题,那就是增加一个物种所需要的生境面积实际上比灭绝一个物种所需要的面积要小得多,由此证明了“种—面积曲线”反推法是导致物种灭绝速率高估的原因。该研究同时提出了准确估计物种灭绝速率新的数学模型,研究结果发表在Nature上。

2)病原菌对森林生物多样性维持的影响

Janzen-Connell假说是群落生态学中维持物种共存的一个重要理论,但有关该假说的研究一直维持在物种水平上。本课题组提出病原菌介导的母树对幼苗的负密度制约与物种间的谱系距离有关。亲缘关系越近的树种被相同病原菌侵染的概率越高,因此在特定成年母树下幼苗死亡率与幼苗和母树间的亲缘距离线性相关,由此证明了“谱系Janzen-Connell作用”。这是在国际上首次通过控制实验手段证明了自然界植物物种亲缘关系对物种的共存起着制约性的影响作用。文章发表在Ecology Letters上。

2、染色质结构调节DNA突变新机制

突变是生物演化的基础,也是疾病发生的主要原因。在A、T、C和G这四种组成人类遗传物质DNA的碱基中,C碱基以极高频率发生水解脱氨(hydrolytic deamination),突变为T碱基。C->T突变在六种碱基置换突变中频率最高,导致了约1/4的人类孟德尔遗传疾病,因此关于这类突变在细胞内是否或如何被调节是一个极具价值的问题。 真核生物细胞中DNA-组蛋白八聚体构成的复合物称为核小体,是染色质的基本结构单元。课题组发现核小体几乎完全抑制水解脱氨来源的C->T 突变,还可以抑制~50%的G->T和A->T突变。这一工作清晰揭示了染色质结构这一重要表观遗传学因子对DNA突变这一核心遗传学因子的调节,同时发现iPS细胞的获得均与染色质结构改变密切相关,该发现对理解相关体细胞突变具有重要意义;同时表明核小体可以通过调节突变方向扮演真核生物基因组GC-含量调节器的角色,对理解真核生物基因组结构及其演化具有重要指导作用。这项工作发表在Science上。

3、斑马鱼胚胎发育中全基因组水平3’UTR的动态变化

通过在基因最后一个外显子选择性多聚腺苷酸化(APA)的作用,一个基因可以转录出具有不同长度3’UTRmRNA异构体(称为tandem 3’UTRs)。全基因组水平tandem 3’UTR的改变在不同的细胞和生理条件下都有报道,暗示了3’UTR重要的调控功能。应用本实验室自主研发的SAPAS技术,我们对斑马鱼胚胎发育的所有主要发育阶段进行全基因组tandem 3’UTR研究。我们发现有43%的蛋白编码基因拥有tandem 3’UTR。在胚胎发育过程中,3’UTR平均长度呈现“V”字形的动态变化:3’UTR首先在合子基因组开始转录的时候变短,然后在原肠胚期迅速变长。超过4,000个基因在发育过程中发生了tandem APA位点switch。通过Gene Ontology分析,发现这些受APA调控的基因有特殊的功能特征。我们找到了三个顺式作用元件(mir430靶点、U-rich元件以及经典polyA信号)在不同发育阶段特异富集,暗示了APA与反式作用因子通过相互作用来调控发育过程。这些结果强调了APA在早期胚胎发育中的重要作用,提示了APA是一种全新层面的调控生理功能的表观遗传机制。研究成果已发表在GENOME RESEARCH上。

4Susumo Ohno假说真伪判定研究

研究运用了很多哺乳动物和有袋类以及鸡的表达量数据证明了性染色体在进化过程中,并没有增加表达量。之后比较了常染色体和性染色在祖先和现代哺乳动物蛋白质的数据,结果也证明了Ohno的假说是不对的。这一工作在本质上否定了剂量补偿效应在哺乳动物中的存在,同时也在哺乳动物的X染色体进化方式上提出全新的模型。这项工作发表在617日的PNAS上(Lin et al, Proc Natl Acad Sci2012 )。

5、豆科植物固氮根瘤形成的分子机理

部分具有III型分泌系统的细菌病原菌能够通过III型分泌系统将III型效应因子分泌到宿主细胞中,从而抵御宿主细胞的防御反应。部分根瘤菌也具有III型分泌系统,能够分泌III型效应因子到豆科植物中干扰宿主的防御反应。在根瘤菌Rhizobia sp. NGR234,几种效应因子(NopL,NopT,NopP,NopM)已经被定性,且与植物的防御反应相关。通过多种传统及现代生化分子技术实验,发现了根瘤菌NGR234的III型效应因子NopM是一种新型的泛素连接酶,且该泛素连接酶活性对于增加扁豆(Lablab purpureus)的结瘤数目有重要作用。同时在其它非宿主细胞,如酵母及烟草的实验中发现NopM与防御反应相关。当其在酵母(Saccharomyces cerevisiae)细胞中表达时,NopM会干扰信息素α-factor激活的MAPK途径。同样当其在烟草(Nicotiana benthamiana)细胞中表达时,NopM能够降低flg22诱导的活性氧(ROS) 的产生。结果表明:当NopM被分泌到宿主扁豆细胞后,能够泛素化宿主细胞防御反应的相关蛋白,导致该蛋白的降解。此次发现对进一步探索根瘤菌III型效应因子在共生固氮作用中的分子机制奠定了良好基础。 该项研究工作发表于PLoS Pathogens

6、植物天然免疫识别机制研究方面取得重要进展

鉴定了两个含LysM(lysin motif)结构的糖基化磷脂酰肌醇锚定蛋白——Os-LYP4与Os-LYP6,发现它们具有识别细菌病原相关分子(肽聚糖)与真菌病原相关分子(几丁质)的双重功能。研究表明,Os-LYP4与Os-LYP6锚定于水稻细胞膜,其表达受病原菌胁迫的快速诱导;体内外系列结合实验证明,它们能分别与肽聚糖以及几丁质发生特异性的结合;通过对水稻转基因植株进行生理检测发现,转基因干涉沉默植株表现出对于水稻细菌病原菌(纹枯病、细条病)以及真菌病原菌(稻瘟病)的耐受程度降低。该研究首次在植物中发现,可识别跨物种(细菌与真菌)微生物病原相关分子的植物模式识别受体。主要研究结果已发表在Plant Cell(2012 tpc.112.102475)。

7、新一代高通量DNA测序技术的应用:

新一代高通量DNA测序技术的应用为广泛开展各类物种或个体的基因组从头测序奠定了基础,同时也带来了新的问题。目前的高通量测序技术极大降低了测序成本,但也存在读长短和错误率高两个缺点。这使得全新物种的特别是高杂合度个体基因组的组装质量无法保证。课题组开发了一系列针对该问题相关算法并整合到名为HaploMerger软件包中。围绕该软件包建立了适于高杂合度基因组测序和组装的完整软件管线。该管线已经应用于中国白氏文昌鱼基因组测序与组装工作中,所获得的基因组质量和所需成本要比目前已知其他同类基因组计划要优越。成果发表于Journal of Molecular Cell Biology

8、自主开发ACTlocater等创新性分析平台,突破对人类微RNA基因转录调控关键技术

(1) 建立了ACTLocator和ChIPBase创新性计算RNA组学平台,全面整合/发掘国际ENCODE计划海量数据,系统解析人类等模式生物中lncRNA、microRNA、snoRNA等主要非编码RNA转录调控及功能网络。解析人类非编码RNA基因与蛋白转录因子的相互作用及细胞特异性,率先完成人类独立转录微RNA基因转录因子的高精度预测及鉴定,提供多维高通量数据的完整视图,突破了高等生物长非编码RNA等重要基因表达调控研究的瓶颈及关键技术,成果已发表在Nucleic Acids Research上。

(2) 揭示了Wnt/β-catenin-miR-372&373正反馈调控通路,研究表明β-catenin /LEF1通过直接结合于miR-371-373基因簇启动子激活miR-371-373表达,而miR- 372&373可通过抑制DKK1等拮抗因子而激活Wnt/β-catenin信号通路。进一步通过慢病毒过表达miR-372/373或抑制DKK1表达以后,发现能促进细胞生长和侵袭。提出miR-372&373通过激活Wnt信号通路促进细胞病变。文章发表在Oncogene上。

9、非编码RNA功能网络

非编码RNA是不参与蛋白质编码的RNA的总称,它们数量众多,占人类基因组转录产物的95%以上。近年来的研究表明,非编码RNA从多方面调控蛋白基因的表达,并与蛋白分子构成调控网络,在细胞的生命活动中发挥着极其重要的功能。研究发现:miR- 125b可通过直接及IL-6R介导的间接方式抑制 Bcl-w、Mcl-1及Bcl-xL等Bcl-2家族的多个抗凋亡分子,促发线粒体凋亡通路,促进细胞自发及低营养、化学药物等刺激诱导的凋亡。以上结果提示,一个miRNA可抑制同一信号通路的不同分子,从而实现对生命活动过程的简便高效调控。该研究成果发表于Oncogene

10、单核/巨噬细胞和T细胞的双向作用介导免疫逃逸
   
吲哚胺2,3双加氧酶(IDO)是色氨酸代谢的限速酶,最近研究表明,在炎性组织的局部微环境中,多种细胞如单核/巨噬细胞、树突状细胞通过高表达IDO,阻止T淋巴细胞的细胞杀伤作用,介导免疫逃逸,但其表达调控机制目前尚不清楚。我们研究发现:组织局部微环境中的巨噬细胞选择性地高表达IDO,而与之相互作用的T细胞大多高表达活化分子CD69;这些活化的CD69+T细胞在体外能够有效诱导巨噬细胞表达IDO蛋白。机制研究发现:巨噬细胞通过分泌促炎症细胞因子IL-12引起T细胞的活化及CD69的表达,而CD69+T细胞可通过分泌炎症因子IFN-γ诱导巨噬细胞中IDO的产生,从而使T细胞失能,介导免疫逃逸。该结果已发表在J Immunol上。

11 蛋白质进化过程中避免误结合假说

基因组数据揭示蛋白质表达量与其进化速率成负相关性(E-R anticorrelation),但目前用于解释这一现象的“翻译稳健性”假说尚存在局限性。据此,我们提出新的“避免误结合”假说,指出高表达的蛋白因受到强的自然选择的作用,其表面的氨基酸表现出“避免误结合”的特性,从而导致高表达的蛋白进化速率减慢,并通过计算生物学的手段验证了该假说。所得结果揭示了蛋白质的误结合是复杂细胞系统的一个遗传特性,可限制蛋白质表面氨基酸的进化,丰富和完善了蛋白质进化学说,发表于Proc Natl Acad Sci USA

12、调控线粒体和端粒细胞结构的信号事件与干细胞领域的研究

研究发现TPP1同时也定位在线粒体上,TPP1TIN2的相互作用区域同时包含了线粒体和端粒定位序列,控制着TIN2的细胞定位。该研究还发现TIN2在线粒体中发生翻译后修饰加工,并调控线粒体氧化磷酸化。该研究结果发现了端粒蛋白与代谢控制的联系,为线粒体假说和端粒假说的信号通路提供了一个交叉结合点,提示了端粒蛋白调控癌症和衰老的另一新机制。该研究发表Cell子刊Molecular Cell杂志上。

13昆虫杆状病毒AcMNPV核心蛋白P6.9和相关基因ac34的研究

(1)AcMNPV核心蛋白P6.9的磷酸化和定位研究

该研究通过酸尿素聚丙烯酰胺凝胶电泳Western blot,发现BV中仅含有去磷酸化的P6.9蛋白,并首次发现ODV中既有去磷酸化的P6.9蛋白,还含有大量磷酸化的P6.9蛋白。BV与ODV中P6.9蛋白磷酸化状态的显著差异,提示核衣壳中P6.9蛋白的磷酸化状态很可能与杆状病毒BV和ODV的相变过程有关。部分研究内容已经在Journal of Virology上发表。

2鳞翅目核多角体病毒特异基因AcMNPV ac34的功能研究

AcMNPV ac34及其同源基因特异性地存在于所有已测序鳞翅目核多角体病毒基因组中。通过空斑实验,及进一步研究ac34的转录时相以及其编码蛋白质的定位情况,而后进一步探索了ac34的缺失影响病毒复制的分子机制。得出ac34对病毒的复制有重要作用,它的缺失使病毒的产量降低了约100倍,延迟了病毒晚期基因的表达,降低晚期基因的转录水平。同时,ac34是病毒在虫体中复制必需的,是AcMNPV的一个毒力因子。该研究成果已在Journal of Virology上发表。

14、光诱导滞育的假说研究

利用双向电泳结合质谱分析结合代谢组学分析,比较了滞育与非滞育棉铃虫幼虫脑在滞育前期受到光照诱导滞育时特异的基因表达异同,发现了差异表达的蛋白49个, 经质谱鉴定出37个蛋白。发现了最后鉴定了差异蛋白41个和磷酸化蛋白23个。根据这些结果,提出光诱导滞育的假说:脑的差异表达蛋白可能通过调节记忆存储把滞育信息储存在脑中;同时产生一些调节因子,导致代谢发生改变,为个体作好营养和抗逆等相关准备,度过不良环境。论文发表在国际知名刊物Journal of Proteome Research

15斜带石斑鱼相关研究

在完成斜带石斑鱼全基因组序列测定的基础上,通过拼接和组装,构建斜带石斑鱼全基因组的精细图谱,组装获得的ContigN50的长度为22.6K, ScaffoldN50的长度为1083.3K。在斜带石斑鱼基因组中共预测得到23043个基因,有22585个基因可以被注释。在此基础上,开展了基因资源的开发与利用研究。

16文昌鱼的相关研究

课题组全面地总结了近十年(2002年至2012年)期间海洋无脊椎动物细胞培养的现状,从组织选材、基础培养基、培养条件等方面,提出建立海洋无脊椎动物细胞系的新观念(Under Review)。研发出了一种适合青岛文昌鱼和白氏文昌鱼的细胞培养液(国家发明专利申请号:201210244521.2)。另外,摸索出了一种文昌鱼细胞系建立方法,并获得专利授权(专利号:ZL2010 1 00612800.0)。

17、生物适应性进化研究

1)基于物种占据面积评估物种灭绝的新模型

研究建立了一个只需基于物种分布数据就可以去估计物种灭绝风险的新模型。这个模型通过计算丢失的物种占据面积去推算相应的种群大小的降低比例。并且,该模型的预测结果得到了大批观测数据的很好验证。研究结果发表于美国生态学会会刊《Ecology》上,且获得“Faculty of 1000 Biology “的推荐。

2异质性生境下半红树植物的遗传结构研究

课题组对来自同一采样地但生境分化(海生潮间带和内陆)的半红树植物黄槿种群进行多地点重复采样,利用基于反转录转座子的特异序列扩增多态性(SSAP)技术分析其遗传多样性及遗传结构。海生种群与陆生种群相比,有较高的遗传多样性和较低的遗传分化;同一地点海陆种群间的遗传分化是不同地点间同种生境种群的遗传分化的两倍。据此推断,尽管黄槿的种子可以随水传播导致强基因流,但歧化选择可对抗基因流的均质化作用,是导致黄槿种群出现生境相关遗传分化的主要机制。该研究发表于Australian Journal of Botany

18严重危害人畜和重要养殖鱼类的寄生虫及重要的病原体系统研究

与锥虫分子生物学研究权威,比利时布鲁塞尔大学的E. Pays教授合作,明确了路氏锥虫抗人血清溶解是由于路氏锥虫缺乏APOL-1受体所致。基于严重危害我国海水养殖的单殖吸虫的系统的生态学和系统演化的研究,提出了单殖吸虫与宿主进化关系的新观点。研究成果分别发表在The Lancet Infectious Diseases,Emerging Infectious Diseases,RNA Biology,The International Journal for ParasitologyParasitology等国际著名刊物。

 

(二)开放课题

实验室2012年共资助开放课题8项,资助金额40万元。合作单位包括约克大学、海南东寨湾国家级自然保护区管理局、广东省农业科学院植物保护研究所、广东省农业科学院植物保护研究所、广州大学地理科学学院、中国科学院植物研究所、广西医学大学基础医学院、西北农林科技大学等高校和研究机构。

本年度利用开放课题基金资助的研究共在SCI杂志上发表论文2篇,获批专利两项、发表会议论文1篇。

其中,彭纯与林浩然团队合作的项目(SKLBCK01)“鱼类microRNAMHCⅡ基因免疫调控作用的研究”,通过stem-loop PCR与同源克隆的方法,得到黑青斑河魨miR-145的成熟肽序列和前体序列。miR-145成熟肽序列与人、鼠、斑马鱼完全一致,共23bpmiR-145前体序列与斑马鱼具有较高的同源性,共80bp。并获得了黑青斑河鲀干扰素IFNγ1及其制备方法和应用黑青斑河鲀干扰素IFNγ2及其制备方法和应用两项专利。

倪广艳与彭少麟团队合作的项目(SKLBC2010K02)“广东省五种主要入侵植物防御与生长间碳的权衡分配”课题 ,提出并初步验证了入侵植物的生长-防御基于碳分配的权衡关系异于本地植物,进一步研究发现这与入侵植物较低的生物量建成成本与较高的资源利用效率密切相关。阐明了华南地区入侵植物成功扩散与其化感作用这一功能性状之间的关系,从理论上进一步丰富和完善了有害植物扩散理论;原产地及生态型与入侵性的关系研究将有助于我们更好的预防外来植物入侵。以上研究结果对于深入理解外来植物成功入侵的生理机制、外来入侵植物对全球碳循环潜在的影响提供理论依据,为有害植物防治和森林管理提供指导。该成果分别发表于Allelopathy Journal和Weed Research。

张军和束文圣团队合作的项目(SKLBC2010K04)“宝山堇菜环肽(cyclotides)的重组表达与抗虫潜力研究”,完成了大环寡肽的重组表达和纯化,并在前期研究了堇菜粗提物具有较的杀虫作用。课题组下一步我们将扩大小菜蛾搜寻范围,以完成重组环肽抗虫试验。在国家重点实验室开放基金等项目的前期支持下,目前已发表中文核心期刊论文两篇和英文论文一篇。另外已完成研究内容有望进一步发表1篇以上的SCI论文。同时将进一步获得两个国家自然科学基金项目的经费资助。

 

二、研究工作和水平

实验室坚持先导性基础研究和应用基础研究并重,以先导性基础研究支持应用基础研究的研究特色,学科发展围绕现有4个研究方向——植物病虫害生物防治、水产畜禽病害控制、海洋生物基因资源与功能、生物适应性进化,重点突破植物病虫害生物防治和动物病害控制中的关键理论和技术。主要针对我国尤其是华南地区的重大有害生物,开展成灾机理、可持续控制的基础和应用技术研究在害虫生物防治、水生经济动物病害控制、海洋动物免疫机制、RNA科学与技术,以及植物适应性进化等领域中形成了自己的特色和优势。

实验室全年在研课题247项,实到科研项目经费9306元,国家级课题经费占72.8%。以本室为第一单位署名发表的SCI收录论文共161篇,其中IF>10的6篇(包括Nature1篇、Science1篇、Ecology Letters 1篇),在5<IF<10的21篇。如,贺雄雷教授一篇有关DNA突变的论文发表在国际顶级期刊《Science》 ,这是中山大学近十年来首次以第一单位在该杂志上发表论文;该研究结果揭示了染色质结构对遗传核心事件——DNA突变的调节机制,对于肿瘤发生机理的研究及防治提供了重要的参考价值,并对理解核生物基因组结构及生物进化具有指导作用;徐安龙教授两篇论文“Dynamic landscape of tandem 3'UTRs during zebrafish development”与“HaploMerger: Reconstructing allelic relationships for polymorphic diploid genome assemblies”在GENOME RESEARCH杂志发表(IF=13.608)。王宏斌教授首次在植物中发现可识别跨物种(细菌与真菌)微生物病原相关分子的植物模式识别受体,该研究成果发表在SCI植物类排名第一的非评论性杂志The Plant Cell上;松阳洲教授团队发现了端粒蛋白TIN2与代谢控制的联系,为线粒体假说和端粒假说的信号通路提供了一个交叉结合点,提示了端粒蛋白调控癌症和衰老的另一新机制,该成果在Cell子刊Molecular Cell杂志上作为封面文章发表;徐安龙教授团队的“脊椎动物免疫的起源与演化”项目荣获2012年度国家自然科学二等奖。林浩然院士在第七届国际鱼类内分泌学大会上荣获“国际鱼类内分泌学会终身成就奖”,这也是我国科学家首次在国际鱼类内分泌学领域荣获的最高奖项。彭宣宪团队的“水产重要病原菌外膜蛋白的功能研究”项目获国家教育部高等学校科学研究成果二等奖,同时其“细菌外膜功能蛋白组学的研究”项目获广东省科学技术奖一等奖。

 

三、队伍建设和人才培养

实验室始终坚持引进与培养相结合,加强高层次人才引进,重点培养优秀中青年人才。现有固定人员80名,包括73名研究人员、 4名技术人员和 3名管理人员。研究人员中拥有中国工程院院士1(林浩然)名、中组部千人计划”4人(2名青年千人)、长江学者特聘教授4(屈良鹄、庄诗美、郑利民、贺雄雷)名、国家杰出青年科学基金获得者8(屈良鹄、徐安龙、施苏华、罗达、何建国、郑利民、庄诗美、贺雄雷)名、国家人事部“百千万人才工程”国家级人选4(屈良鹄、徐安龙、陈瑶生、何建国)名、广东省珠江学者特聘教授2(彭少麟、束文圣)名、教育部新(跨)世纪优秀人才 9名。现有教育部创新团队2个,广东省创新科研团队2个,广东省高等学校千百十工程先进团队2个。一批中青年优秀人才逐渐脱颖而出,为实验室的长远发展奠定了人才基础。

始终坚持引进与培养相结合,加强高层次人才引进,重点培养优秀中青年人才。本年度新引进了中组部“青年千人计划”肖仕、赵勇、中山大学“百人计划”谢玉龙、陈琴芳、刘阳、黄燕等杰出的青年优秀人才。郭金虎教授获2012年教育部新世纪优秀人才计划,徐安龙、屈良鹄教授入选2012年度广东省百名南粤杰出人才培养对象。

为客观评价PI-团队制的实施成效,为实验室未来发展总结经验和教训,继续保持团队创新活力,引入国际同行专家评议机制对32个PI团队进行了2011年度考核,评定出优秀、良好和其他PI-团队,其中,12个团队被评为2011年度考核优秀“PI-团队”,将获得科研业务奖励资助。考核结果与实验室科研资源配置相结合,优秀团队获得科研业务费奖励,并获得开放课题、学术交流等优先支持。这对进一步优化人才队伍,调动实验室创新活力,对学科方向间的交叉融合、重大成果的培育起到了积极的促进作用。

实验室继续加强年轻教师与研究生生力军的培养,多渠道寻求资源促使青年教师和研究生参加各种国际学术交流。提高了博士生科研津贴额度并扩大了发放范围,全年共支出博士生发放科研津贴135.5万元。年度研究生奖(分设杰出研究生奖、优秀研究生奖、协作贡献奖、最佳演讲奖与最佳墙报奖等),共为 37名研究生发放共17万元奖学金。2012年新设立捐赠奖学金“生物防治奖学金”,用于奖励生活条件艰苦、品学兼优的研究生。在缓解研究生生活压力的同时更增强了他们对实验室的归属感。

 

四、学术交流与运行管理

(一)学术交流

本年度共有120多位境外专家学者和30多位国内专家来室交流和讲学,主办或承办了5次全国性或国际性学术会议,共开设学术系列讲座27场,邀请专家包括英国皇家科学院院士杨子恒教授、美国科学院院士李家洋教授、美国马里兰大学王建教授、美国南加州大学高守疆教授等。全年师生出访共350人次,其中有76人次应邀在国内外重要学术会议上做了特邀请报告。主持在研国际合作项目7项,外资来源和合作单位包括澳门政府、日本冈山县生物科学综合研究所、美国孟德尔生物技术有限公司等,年度经费(外资)138万元。

4月16-19,由华人生物学家协会主办,我室协办的2012年第四届国际生物医学和环境科学技术大会(icBEST2012),暨基因组稳定性和人类疾病国际大会在中山大学东校区顺利召开。本届大会主题为“基因组稳定性和癌症发展”。包括美国科学院院士、哈佛大学医学院Stephen J. Elledge教授等在内的300余位国内外专家学者出席了大会。大会由松阳洲教授和美国西南大学安德森癌症中心李磊教授共同主持,徐安龙主任出席大会开幕式并致辞。大会8场专题研讨会共进行了45个大会报告和1场论文海报展示,内容包括DNA损伤信号和DNA损伤修复、端粒生物学、衰老和环境基因毒理学的机制、癌症生物学和癌症干预相关的研究成果。

11月5-10日,“第二届中俄东亚植物群演化与发展学术研讨会”在我室召开,来自俄罗斯、美国及国内十余所科相关科研机构的40余位古植物学和植物学领域专家学者参加了本次会议。会议就被子植物的起源和早期演化、植物与昆虫协同进化、华南地区始新世植物多样性、古植物解剖学、古气候学、第四纪孢粉学,以及植物区系学等领域展开了广泛深入的交流和研讨,与会者一致认为中俄科学家在古植物学和植物学领域具有相当好的合作基础,近年来的合作与交流已取得显著成效,包括黑龙江流域K/T(K/Pg)界线研究以及华南地区始新世植物多样性与古气候研究等已取得多项重要成果,今后应进一步加强中俄同行之间以及学科之间的交流与合作,充分发挥在各自学科、技术、信息和地域等方面的优势,不断发现新的合作“生长点”,并进一步拓宽合作领域及合作规模。    

11月29-30日,由我室与中国水产科学研究院珠江水产研究所、广东省淡水名优鱼类种苗繁育中心在广州市联合举办了“罗非鱼健康养殖与病害防控技术研讨会”,珠江所科研处负责人以及罗非鱼产业技术体系的相关岗位专家、综合试验站站长、示范县(区)负责人和团队成员等共60多人参加本次会议。会上,珠江所高风英和刘志刚分别作了“罗非鱼流行病学及无乳链球菌抗原蛋白的免疫学研究”、“尼罗罗非鱼MHC基因研究及其在抗病育种的应用潜力”的学术报告,我室4位研究生作了“罗非鱼凋亡因子TRAIL、FasL基因克隆及其与TNF-a的原核表达”、“罗非鱼胆囊收缩素及其受体的克隆和功能研究”、“罗非鱼TGF-β受体的克隆、组织分布以及多克隆抗体制备”、“投喂模式对尼罗罗非鱼生长和代谢的影响”等的学术交流。与会代表深入讨论了罗非鱼健康养殖技术和养殖过程中可能出现的病害以及当前罗非鱼链球菌病的现状和罗非鱼链球菌疫苗的研究和应用进展。

11月20-22日,郭金虎团队主办的“2012年生物昼夜节律学术研讨会”在广州大学城召开,。会议邀请了北京大学、武汉大学、苏州大学、南京理工大学、南京师范大学、华南理工大学以及中国航天员中心的20多位专家出席。与会专家围绕生物节律这一中心问题,探讨了从粗糙脉孢霉到人等一系列生物中生物节律调控生理功能的现象及机理,并进一步展开探讨航天条件下生物中的变化规律与机制,以及生物中与相关药物之间的联系。

12月18日,邀请了微尺度物质科学国家重点实验室史庆华博士、香港大学李嘉诚医学院刘宝华博士、香港科技大学屠琳娜博士、上海交通大学特别研究员蒙国宇博士、美国贝勒医学院崔隽博士以及我室杨建华副教授做客第四届阳光前沿科学论坛,共同分享了在MicroRNA与免疫、衰老等相关科学问题中的结构生物学与生物信息学学科前沿成果。

(二)公共平台建设

继续完善“集中管理、开放共享”的公共平台建设机制,包括公共试剂耗材管理与大型仪器预约两个子系统的实验室公共平台管理系统正式上线运行。实验室常用试剂耗材集中供应室STOREROOM继续秉承“相同产品最低价准入、包退包换与及时获取”原则,已引入20多个商家共300余种商品,网上管理系统的成功运行进一步方便了不同校区的更多师生获取各方信息,有利于对各商家、商品及其运营状况进行客观的评价和判断,团队申领、审批、结算等流程也更加快捷和规范,进而实现信息公开、服务公平、管理公正的实验室管理与服务理念,深得广大师生的支持和信赖。培训制度的不断完善和仪器预约系统的正式上线,大大提高了大型仪器管理效率,重点依靠供应商技术力量提供的装机、验收及不定期回访组织技术培训,邀请同行专家进行专题讲座,全年共举行新技术新方法系列讲座10余场次;派出技术人员参与学习交流(电镜、液相等)。利用仪器设备专项经费新购置了全自动精子分析系统、振动切片机、多功能分析仪、寻晶者等公共设备,对超微结构平台和生物影像平台部分设备进行了升级改造,组织开展了测序仪、鱼类疫苗注射机、鱼类生理监测系统、生态养殖系统四台(套)仪器与系统装备的自主研发,并开展了昆虫饲养室、模式动物文昌鱼维生系统、二级生物安全实验室等建设与改造,补充了一批保障公共平台正常运行的急需的小型配套辅助设备,进一步改善了实验室科研环境。

(三)日常运行管理

完善实验室会议制度,通过召开实验室全体成员会议、全体PI会议、PI考核暨学术交流会议等,不断增强实验室成员的参与意识与归属感;充分发挥各工作委员会的议事职能,各工作委员会年内分别召开了1-2次全体会议对科研业务费的分配、学术交流各项资助申请、大型仪器设备购置与公共平台建设、研究生管理等重大事项进行讨论评议;设立主任办公会对各项重大事项进行决策,对各项工作的科学决策和推动起到了积极作用;实验室办公室例会改为每周一次,对日常工作进行充分的沟通和梳理。实验室日常工作更加细致,开拓性地开展了本科生暑期夏令营、学术与人生讲座、中学生科技节、备战IGEM大赛等丰富多样的学生活动,深圳研发中心的工作正逐步成为实验室日常管理的重要组成部分,不断完善的网站建设、通讯、年报、橱窗海报等媒介载体有效扩大了实验室和学校的社会影响力,形成了积极向上、开放共享、和谐创新的良好氛围。

 

五、实验室公众开放活动

本着换位思考的原则,从不同受众视角出发开展多层面的公共开放活动。面向校内大学生发起开设了学术人生周末论坛,邀请全体PI与社会知名人士做客每周论坛,与学生们共同分享学术人生路上的苦与乐。面向全校招募生物信息学兴趣爱好者,设立专项组建培育了SYSU-Software团队备战国际IGEM大赛,一举获得亚洲区金牌,并获全球总决赛7个单项奖中的两项,深得国际评委欣赏。“2012年中山大学生命科学夏令营”活动收到了来自全国59所高校近200多名大三学生的申请,其中80%以上为“985”、“211”工程院校的优秀学子。经实验室资格筛选、专家评审,最终遴选出100名优秀学生参加此次活动,不仅增进了他们对实验室的了解,实现了与心仪导师面对面沟通的愿望,更重要的是夏令营成为了营员们相互交流和学习的平台。联合光电材料国家重点实验室、数字家庭国家工程研究中心、南海海洋生物国家工程研究中心,为中山大学附属中学科技节组织了一场别开生面的科技巡游活动,600余名中学生“走进国家重点科研机构”,与前沿学术零距离接触。生物博物馆则面向全社会开放,2012年全年接待参观人员1.14万人次,其中免费接待0.83万人次,实现了对所有广州市内未成年人和65岁以上长者免费开放,接待国内外来馆研究馆藏标本的科研人员共约30人。

 

六、实验室大事记

2012.2        我室余世孝教授在Ecology Letters 发表文章

2012.2.17     广东省副省长许瑞生来室视察

2012.2.23     我室何芳良教授在Nature主刊上发表文章

2012.3.9      我室贺雄雷教授在Science发表文章

2012.3.14     我室科技特派员参加广东海纳现代农业生态园区奠基仪式

2012.3.15     河海大学水文水资源与水利工程科学国家重点实验室来我室交流访问

2012.3.25     教育部教学仪器研究所韩呼生所长一行来室考察调研

2012.3.30     深圳市科技创新委、南山区政府领导视察我室深圳研发中心

2012.4.16-19 举办第四届国际生物医学和环境科学技术大会

2012.5.9      深水网箱技术创新项目获得第八届挑战杯广东大学生创业计划竞赛金奖

2012.5.17-18  举办2011年度PI考核暨学术交流会议

2012.5.19      黎祖福等老师指导团队获得第八届挑战杯广东大学生创业计划竞赛金奖

2012.5.23-27   我室参加第十五届中国北京国际科技产业博览会暨首届海洋科技展

2012.6.8       我室应邀参加深圳第十届官产学研资介洽谈会,设立生物防治奖学金

2012.6.19      纪念蒲蛰龙院士诞辰一百周年

2012.6.20      举办2011年度研究生学术年会暨研究生奖评奖活动

2012.7.10-14   主办2012年中山大学生命科学学术夏令营

2012.7.20      中组部人才局宋永华副局长来室参观

2012.8.5-8     协办全国青少年高校科学营中山大学分营

2012.9.6     林浩然院士荣获“国际鱼类内分泌学会终身成就奖”

2012.9.18-19   深圳虚拟大学园领导及其成员单位领导来我室参观

2012.9.27-28   中山大学附属中学科技节科技巡游活动——“走进国家重点科研机构”

2012.11.5    SYSU-Software参赛队在国际总决赛获软件组的最佳iGEM软件框架应用(Best Clotho App)和最佳基因组编译器设计(Best Genome Compiler-Based Design) 大奖

2012.11.15     实验室第五届学术委员会第四次会议在京召开

2012.11.5-10   举办第二届中俄东亚植物群演化与发展学术研讨会

2012.11.25-27 国家重点实验室昆虫学研究前沿学术研讨会(暨国家重点实验室联合论坛)在北京举行

2012.11.28-30 举办“罗非鱼健康养殖与病害防控技术”研讨会

2012.11.28   束文圣、李金天老师指导项目在创新南山2012 “创业之星”大赛中取得优异成绩

2012、12、10   实验室2012年第2次学术交流委员会召开,学术交流管理办法做重要修订

2012.12.13-15 参加首届深圳国际生物科技创新论坛暨展览会

2012.12.18     举办第四届阳光前沿科学论坛

 

七、依托单位与主管部门的支持

 

依托单位对实验室建设以及运行管理方面等坚持给予了大力支持,在人、财、物等各方面的资源配置上均对实验室予以倾斜。

1、在人才队伍方面,依托单位优先满足重点实验室发展需要的人才引进和人才培养,为实验室储备引进容益康等优秀人才,新增长江学者和国家杰青贺雄雷教授、青年千人肖仕和赵勇教授、新世纪优秀人才郭金虎教授、珠江学者束文圣教授等,王宏斌、黄立南被晋聘为教授。

2、在学科建设方面,学校为实验室配套了20万元运行管理费及科研助手支持计划20万元,用于实验室奖励优秀科研成果等。在985三期和211工程建设中,学校通过向依托学院倾斜给予实验室相应的支持。

3、在场地等后勤资源保障方面,学校一向优先保障重点实验室科研用场地、水电等资源。

       4、在运行管理方面,学校领导及各相关部门在政策上给予了充分指导和协调,特别是在保证实验室开放运行方面,学校科技处、设备处、财务处、外事处、总务处、房地产处等部门对实验室科研合作、对外交流、公共平台建设等给予了有力的支持和帮助;实验室各工作委员会成员均有邀请依托学院相关领导担任,便于与学院整体工作相衔接,利于资源效益最大化。

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